Бюллетень Московского общества испытателей природы. Отдел биологический
Bulletin of Moscow Society of Naturalists.<br /> Biological Series
Перейти в оглавление выпуска:
2017. T. 122. Vyp. 1.
Go to the issue table of contents:
2017. T. 122. Vyp. 1.

Данные статьи

Description

DOI

No

Авторы:

Authors:

Kashin A.S., Kritskaya T.A., Popova A.O., Parkhomenko A.S.

Ключевые слова:

Keywords:

Asteraceae, Chondrilla, ISSR, cluster analysis, molecular systematics.

Скачать pdf статьи:

Download the article:

Ссылка для цитирования:

For citation:

Kashin A.S., Kritskaya T.A., Popova A.O., Parkhomenko A.S., ISSR Analysis of GeneticDiversity of Chondrilla Species (Asteraceae) in European Part of Russia // Byul. MOIP. Otd. biol. 2017. T. 122. Vyp. 1. S. 60-70

ISSR Analysis of GeneticDiversity of Chondrilla Species (Asteraceae) in European Part of Russia

The genetic diversity of twenty-one populations of Chondrilla from European part of Russia was analysed using the inter-sequence simple repeat markers (ISSR). The cluster analysis (UPGMA) and the unrooted tree built using the neighbour joining method yielded similar results, according to which the samples were subdivided into two major groups: the first group comprising C. ambigua and C. brevirostis forming private subclusters, and the second group comprizing all the other samples.

References

  • Благовещенский В.В., Пчелкин Ю.А., Раков Н.С., и др. Определитель растений Среднего Поволжья. Л., 1984. 392 с. [Blagoveshchenskii V.V., Pchelkin Yu.A., Rakov N.S., et al. Opredelitel’ rastenii Srednego Povolzh’ya. L., 1984. 392 s.].
  • Губанов И.А., Кисилева К.В., Новиков В.С., Тихомиров В.Н. Определитель сосудистых растений. М., 1992. 400 с. [Gubanov I.A., Kisileva K.V., Novikov V.S., Tikhomirov V.N. Opredelitel’ sosudistykh rastenii. M., 1992. 400 s.].
  • Еленевский А.Г., Буланый Ю.И., Радыгина В.И. Конспект флоры Саратовской области. Саратов, 2008а. 232 с. [Elenevskii A.G., Bulanyi Yu.I., Radygina V.I. Konspekt flory Saratovskoi oblasti. Saratov, 2008a. 232 s.].
  • Еленевский А.Г., Буланый Ю.И., Радыгина В.И. Определитель сосудистых растений Саратовской области. Саратов, 2008б. 248 с. [Elenevskii A.G., Bulanyi Yu.I., Radygina V.I. Opredelitel’ sosudistykh rastenii Saratovskoi oblasti. Saratov, 2008b. 248 s.].
  • Ильин М.М. Chondrilla L. // Бюл. отдел. каучукон. 1930. № 3. С. 1−61 [Il’in M.M. Chondrilla L. // Byul. otdel. kauchukon. 1930. № 3. S. 1−61].
  • Кашин А.С., Попова А.О., Угольникова Е.В., и др. Некоторые параметры системы семенного размножения в популяциях видов Chondrilla L. Нижнего Поволжья // Бот. журн. 2015. Т. 100. № 8. С. 828−840 [Kashin A.S., Popova A.O., Ugol’nikova E.V., et al. Nekotorye parametry sistemy semennogo razmnozheniya v populyatsiyakh vidov Chondrilla L. Nizhnego Povolzh’ya // Bot. zhurn. 2015. T. 100. № 8. S. 828−840].
  • Кашин А.С., Петрова Н.А., Попова. А.О., Шилова И.В., Полякова Ю.А. Морфологическая изменчивость в популяциях видов Chondrilla L. европейской части России // Изв. Саратовского ун-та. Новая серия. Сер. Химия. Биология. Экология. 2016. Т. 16. Вып. 1. С. 80–90 [Kashin A.S., Petrova N.A., Popova. A.O., Shilova I.V. Polyakova Yu.A. Morfologicheskaya izmenchivost’ v populyatsiyakh vidov Chondrilla L. evropeiskoi chasti Rossii // Izv. Saratovskogo un-ta. Novaya seriya. Ser. Khimiya. Biologiya. Ekologiya. 2016. T. 16. Vyp. 1. S. 80–90].
  • Копылов-Гуськов Ю.О., Крамина Т.Е. Изучение Stipa ucrainica и Stipa zalesskii (Poaceae) из Ростовской области с использованием морфологического и ISSR-анализов // Бюл. МОИП. Отд. биол. 2014. Т. 119.                     № 5. С. 46−53 [Kopylov-Gus’kov Yu.O., Kramina T.E. Izuchenie Stipa ucrainica i Stipa zalesskii (Poaceae) iz Rostovskoi oblasti s ispol’zovaniem morfologicheskogo i ISSR-analizov // Byul. MOIP. Otd. biol. 2014. T. 119.              № 5. S. 46−53].
  • Леонова Т.Г. Род. Хондрилла – Chondrilla L. // Флора СССР. М.; Л., 1964. С. 560−586 [Leonova T.G. Rod. Khondrilla – Chondrilla L. // Flora SSSR. M.; L., 1964. S. 560−586].
  • Леонова Т.Г. Хондрилла – Chondrilla L. // Флора Европейской части СССР. Т. 8. Л., 1989. С. 57–61 [Leonova T.G. Khondrilla – Chondrilla L. // Flora Evropeiskoi chasti SSSR. T. 8. L., 1989. S. 57–61].
  • Маевский П.Ф. Флора средней полосы европейской части России. М., 2006. 600 с. [Maevskii P.F. Flora srednei polosy evropeiskoi chasti Rossii. M., 2006. 600 s.].
  • Маевский П.Ф. Флора средней полосы европейской части России. М., 2014. 635 с. [Maevskii P.F. Flora srednei polosy evropeiskoi chasti Rossii. M., 2014. 635 s.].
  • Маевский П.Ф. Флора средней полосы Европейской части СССР. М.; Л., 1940. 824 с. [Maevskii P.F. Flora srednei polosy Evropeiskoi chasti SSSR. M.; L., 1940. 824 s.].
  • Поддубная-Арнольди В.А. Цитоэмбриология покрытосеменных растений. М., 1976. 507 с. [Poddubnaya-Arnol’di V.A. Tsitoembriologiya pokrytosemennykh rastenii. M., 1976. 507 s.].
  • Талиев В.И. Определитель высших растений Европейской части СССР. М.; Л., 1928. 630 с. [Taliev V.I. Opredelitel’ vysshikh rastenii Evropeiskoi chasti SSSR. M.; L., 1928. 630 s.].
  • Флора Азербайджана. Т. 8. Баку, 1961. 676 c. [Flora Azerbaidzhana. T. 8. Baku, 1961. 676 c.].
  • Флора Юго-Востока Европейской части СССР. Вып. VI (Pirolaceae–Compositae) / Б.К. Шишкин. М.; Л., 1936. 484 с. [Flora Yugo-Vostoka Evropeiskoi chasti SSSR. Vyp. VI (Pirolaceae–Compositae) / B.K. Shishkin. M.; L.; 1936. 484 s.].
  • Черепанов С.К. Сосудистые растения России и сопредельных государств (в пределах бывшего СССР). СПб., 1995. 992 с. [Cherepanov S.K. Sosudistye rasteniya Rossii i sopredel’nykh gosudarstv (v predelakh byvshego SSSR). SPb., 1995. 992 s.].
  • Шанцер И.А., Вагина А.В., Остапко В.М. Критическое исследование шиповников (Rosa L.) заповедника Хомутовская степь // Бюл. МОИП. Отд. биол. 2011. Т. 116. № 3. С. 38–48. [Shanzer I.A., Vagina A.V., Ostapko V.M. Kriticheskoe issledovanie shipovnikov (Rosa L.) zapovednika «Khomutovskaya step’» // Byul. MOIP. Otd. biol. 2011. T. 116. № 3. S. 38–48].
  • Шанцер И.А., Войлокова В.Н. Сколько видов, родственных Rosa majalis, растет в европейской части России? // Бот. журн. 2008. Т. 93. № 11. С. 1690–1704 [Shanzer I.A., Voilokova V.N. Skol’ko vidov, rodstvennykh Rosa majalis, rastet v evropeiskoi chasti Rossii? // Bot. zhurn. 2008. T. 93. № 11. S. 1690–1704].
  • Bergman B. Chondrilla chondrilloides, a new sexual Chondrilla species // Hereditas. 1952. Vol. 38. N. 3. P. 367−369.
  • Dijk van P.J. Ecological and evolutionary opportunities of apomixis: insights from Taraxacum and Chondrilla // Phil. R. Soc. Lond. B. 2003. Vol. 358. P. 1113−1121.
  • Dogan B., Duran A., Hakki E.E. Phylogenetic analysis of Jurinea (Asteraceae) species from Turkey based on ISSR amplification // Ann. Bot. Fennici. 2007. Vol. 44. P. 353−358.
  • Escaravage N., Cambecèdes J., Largier G, Pornon, A. Conservation genetics of the rare Pyreneo-Cantabrian endemic Aster pyrenaeus (Asteraceae) // AoB PLANTS. 2011. doi:10.1093/aobpla/plr029.
  • Gaskin J.F., Schwarzländer M., Kinter C. L., Smith J.F., Novak S.J. Propagule pressure, genetic structure, and geographic origins of Chondrilla juncea (Asteraceae): an apomictic invader on three continents // Amer. J. Bot. 2013. Vol. 100. N 9. P. 1871–1882.
  • Hammer O., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Palaeontological Statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. 2001. Vol. 4. N 1. 9 p.
  • Huson D.H., Bryant D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies // Mol. Biol. Evol. 2006. Vol. 23. N 2. P. 254–267.
  • Kloepper T.H., Huson D.H. Drawing explicit phylogenetic networks and their integration into SplitsTree // BMC Evol. Biol. 2008. Vol. 8. P. 22.
  • Nei M., Li W. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc Nat Acad Sci USA. 1979. Vol. 76. P. 5269–5273.
  • Noyes R.D. Apomixis in the Asteraceae: Diamonds in the Rough // Functional plant science and biotechnology. 2007. Vol. 1. N 2. P. 207−222.
  • Ryu J., Bae C.-H. Genetic diversity and relationship analysis of genus Taraxacum accessions collected in Korea // Korean J. Plant Res. 2012. Vol. 25. N 3. P. 329−338.
  • Wolfe A.D., Хiаng Q.-Y., Kephart S.R. Assessing hybridization in nаturаl populations of Реnstеmоn (Scrophulariaceae) using hypervariable inter-simple sequence rереаt (ISSR) bands // Mol. Ecol. 1998. Vol. 7. N 9. Р. 1107–1125.

Список литературы

  • Благовещенский В.В., Пчелкин Ю.А., Раков Н.С., и др. Определитель растений Среднего Поволжья. Л., 1984. 392 с. [Blagoveshchenskii V.V., Pchelkin Yu.A., Rakov N.S., et al. Opredelitel’ rastenii Srednego Povolzh’ya. L., 1984. 392 s.].
  • Губанов И.А., Кисилева К.В., Новиков В.С., Тихомиров В.Н. Определитель сосудистых растений. М., 1992. 400 с. [Gubanov I.A., Kisileva K.V., Novikov V.S., Tikhomirov V.N. Opredelitel’ sosudistykh rastenii. M., 1992. 400 s.].
  • Еленевский А.Г., Буланый Ю.И., Радыгина В.И. Конспект флоры Саратовской области. Саратов, 2008а. 232 с. [Elenevskii A.G., Bulanyi Yu.I., Radygina V.I. Konspekt flory Saratovskoi oblasti. Saratov, 2008a. 232 s.].
  • Еленевский А.Г., Буланый Ю.И., Радыгина В.И. Определитель сосудистых растений Саратовской области. Саратов, 2008б. 248 с. [Elenevskii A.G., Bulanyi Yu.I., Radygina V.I. Opredelitel’ sosudistykh rastenii Saratovskoi oblasti. Saratov, 2008b. 248 s.].
  • Ильин М.М. Chondrilla L. // Бюл. отдел. каучукон. 1930. № 3. С. 1−61 [Il’in M.M. Chondrilla L. // Byul. otdel. kauchukon. 1930. № 3. S. 1−61].
  • Кашин А.С., Попова А.О., Угольникова Е.В., и др. Некоторые параметры системы семенного размножения в популяциях видов Chondrilla L. Нижнего Поволжья // Бот. журн. 2015. Т. 100. № 8. С. 828−840 [Kashin A.S., Popova A.O., Ugol’nikova E.V., et al. Nekotorye parametry sistemy semennogo razmnozheniya v populyatsiyakh vidov Chondrilla L. Nizhnego Povolzh’ya // Bot. zhurn. 2015. T. 100. № 8. S. 828−840].
  • Кашин А.С., Петрова Н.А., Попова. А.О., Шилова И.В., Полякова Ю.А. Морфологическая изменчивость в популяциях видов Chondrilla L. европейской части России // Изв. Саратовского ун-та. Новая серия. Сер. Химия. Биология. Экология. 2016. Т. 16. Вып. 1. С. 80–90 [Kashin A.S., Petrova N.A., Popova. A.O., Shilova I.V. Polyakova Yu.A. Morfologicheskaya izmenchivost’ v populyatsiyakh vidov Chondrilla L. evropeiskoi chasti Rossii // Izv. Saratovskogo un-ta. Novaya seriya. Ser. Khimiya. Biologiya. Ekologiya. 2016. T. 16. Vyp. 1. S. 80–90].
  • Копылов-Гуськов Ю.О., Крамина Т.Е. Изучение Stipa ucrainica и Stipa zalesskii (Poaceae) из Ростовской области с использованием морфологического и ISSR-анализов // Бюл. МОИП. Отд. биол. 2014. Т. 119.                     № 5. С. 46−53 [Kopylov-Gus’kov Yu.O., Kramina T.E. Izuchenie Stipa ucrainica i Stipa zalesskii (Poaceae) iz Rostovskoi oblasti s ispol’zovaniem morfologicheskogo i ISSR-analizov // Byul. MOIP. Otd. biol. 2014. T. 119.              № 5. S. 46−53].
  • Леонова Т.Г. Род. Хондрилла – Chondrilla L. // Флора СССР. М.; Л., 1964. С. 560−586 [Leonova T.G. Rod. Khondrilla – Chondrilla L. // Flora SSSR. M.; L., 1964. S. 560−586].
  • Леонова Т.Г. Хондрилла – Chondrilla L. // Флора Европейской части СССР. Т. 8. Л., 1989. С. 57–61 [Leonova T.G. Khondrilla – Chondrilla L. // Flora Evropeiskoi chasti SSSR. T. 8. L., 1989. S. 57–61].
  • Маевский П.Ф. Флора средней полосы европейской части России. М., 2006. 600 с. [Maevskii P.F. Flora srednei polosy evropeiskoi chasti Rossii. M., 2006. 600 s.].
  • Маевский П.Ф. Флора средней полосы европейской части России. М., 2014. 635 с. [Maevskii P.F. Flora srednei polosy evropeiskoi chasti Rossii. M., 2014. 635 s.].
  • Маевский П.Ф. Флора средней полосы Европейской части СССР. М.; Л., 1940. 824 с. [Maevskii P.F. Flora srednei polosy Evropeiskoi chasti SSSR. M.; L., 1940. 824 s.].
  • Поддубная-Арнольди В.А. Цитоэмбриология покрытосеменных растений. М., 1976. 507 с. [Poddubnaya-Arnol’di V.A. Tsitoembriologiya pokrytosemennykh rastenii. M., 1976. 507 s.].
  • Талиев В.И. Определитель высших растений Европейской части СССР. М.; Л., 1928. 630 с. [Taliev V.I. Opredelitel’ vysshikh rastenii Evropeiskoi chasti SSSR. M.; L., 1928. 630 s.].
  • Флора Азербайджана. Т. 8. Баку, 1961. 676 c. [Flora Azerbaidzhana. T. 8. Baku, 1961. 676 c.].
  • Флора Юго-Востока Европейской части СССР. Вып. VI (Pirolaceae–Compositae) / Б.К. Шишкин. М.; Л., 1936. 484 с. [Flora Yugo-Vostoka Evropeiskoi chasti SSSR. Vyp. VI (Pirolaceae–Compositae) / B.K. Shishkin. M.; L.; 1936. 484 s.].
  • Черепанов С.К. Сосудистые растения России и сопредельных государств (в пределах бывшего СССР). СПб., 1995. 992 с. [Cherepanov S.K. Sosudistye rasteniya Rossii i sopredel’nykh gosudarstv (v predelakh byvshego SSSR). SPb., 1995. 992 s.].
  • Шанцер И.А., Вагина А.В., Остапко В.М. Критическое исследование шиповников (Rosa L.) заповедника Хомутовская степь // Бюл. МОИП. Отд. биол. 2011. Т. 116. № 3. С. 38–48. [Shanzer I.A., Vagina A.V., Ostapko V.M. Kriticheskoe issledovanie shipovnikov (Rosa L.) zapovednika «Khomutovskaya step’» // Byul. MOIP. Otd. biol. 2011. T. 116. № 3. S. 38–48].
  • Шанцер И.А., Войлокова В.Н. Сколько видов, родственных Rosa majalis, растет в европейской части России? // Бот. журн. 2008. Т. 93. № 11. С. 1690–1704 [Shanzer I.A., Voilokova V.N. Skol’ko vidov, rodstvennykh Rosa majalis, rastet v evropeiskoi chasti Rossii? // Bot. zhurn. 2008. T. 93. № 11. S. 1690–1704].
  • Bergman B. Chondrilla chondrilloides, a new sexual Chondrilla species // Hereditas. 1952. Vol. 38. N. 3. P. 367−369.
  • Dijk van P.J. Ecological and evolutionary opportunities of apomixis: insights from Taraxacum and Chondrilla // Phil. R. Soc. Lond. B. 2003. Vol. 358. P. 1113−1121.
  • Dogan B., Duran A., Hakki E.E. Phylogenetic analysis of Jurinea (Asteraceae) species from Turkey based on ISSR amplification // Ann. Bot. Fennici. 2007. Vol. 44. P. 353−358.
  • Escaravage N., Cambecèdes J., Largier G, Pornon, A. Conservation genetics of the rare Pyreneo-Cantabrian endemic Aster pyrenaeus (Asteraceae) // AoB PLANTS. 2011. doi:10.1093/aobpla/plr029.
  • Gaskin J.F., Schwarzländer M., Kinter C. L., Smith J.F., Novak S.J. Propagule pressure, genetic structure, and geographic origins of Chondrilla juncea (Asteraceae): an apomictic invader on three continents // Amer. J. Bot. 2013. Vol. 100. N 9. P. 1871–1882.
  • Hammer O., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Palaeontological Statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. 2001. Vol. 4. N 1. 9 p.
  • Huson D.H., Bryant D. Application of Phylogenetic Networks in Evolutionary Studies // Mol. Biol. Evol. 2006. Vol. 23. N 2. P. 254–267.
  • Kloepper T.H., Huson D.H. Drawing explicit phylogenetic networks and their integration into SplitsTree // BMC Evol. Biol. 2008. Vol. 8. P. 22.
  • Nei M., Li W. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases // Proc Nat Acad Sci USA. 1979. Vol. 76. P. 5269–5273.
  • Noyes R.D. Apomixis in the Asteraceae: Diamonds in the Rough // Functional plant science and biotechnology. 2007. Vol. 1. N 2. P. 207−222.
  • Ryu J., Bae C.-H. Genetic diversity and relationship analysis of genus Taraxacum accessions collected in Korea // Korean J. Plant Res. 2012. Vol. 25. N 3. P. 329−338.
  • Wolfe A.D., Хiаng Q.-Y., Kephart S.R. Assessing hybridization in nаturаl populations of Реnstеmоn (Scrophulariaceae) using hypervariable inter-simple sequence rереаt (ISSR) bands // Mol. Ecol. 1998. Vol. 7. N 9. Р. 1107–1125.

Бюллетень МОИП (отд. биол.) не входит в Web of Science Core Collection, но индексируется в пяти продуктах компании Thomson Reuters на платформе Web of Science —  Russian Science Citation Index, BIOSIS Previews, BIOSIS Citation Index, Biological Abstracts, Zoological Record.

 

Бюллетень МОИП (отд. биол.) входит в число журналов из списка RSCI, в связи с чем, согласно Рекомендациям ВАК от 26.10.2022 г. (пункт 5), приравнен к журналам Перечня ВАК из К1.

Bulletin of the MOIP (ed. biol.) It is not included in the Web of Science Core Collection, but is indexed in five Thomson Reuters products on the Web of Science platform — Russian Science Citation Index, BIOSIS Previews, BIOSIS Citation Index, Biological Abstracts, Zoological Record.

The Bulletin of the MOIP (otd. biol.) is one of the journals from the RSCI list, and therefore, according to the Recommendations of the Higher Attestation Commission of 10/26/2022 (item 5), it is equated to the journals of the Higher Attestation Commission List from K1.