В статье приведены сведения, направленные на уточнение таксономического статуса вида Primula mazurenkoae (секция Aleuritia, Primulaceae) и определение уровня его генетической дивергенции по отношению к морфологически близкому P. farinosa. Для изучения генетических связей между близкородственными видами было выполнено ISSR-маркирование с помощью пяти праймеров и исследованы 23 нуклеотидные последовательности локуса ITS ярДНК, 20 из которых получены в настоящем исследовании. Генетический анализ показал высокий уровень вариабельности P. mazurenkoae и сложную гетерогенную структуру его природных популяций. Установлено, что морфологически близкие виды P. mazurenkoae и P. farinosa характеризуются также высокой степенью генетического сходства, выявленного методом ISSR-анализа и секвенированием внутренних транскрибируемых спейсеров ITS ядерной рибосомальной ДНК.
2023. Т. 128. Вып. 5.
2023. Т. 128. Вып. 5.
Данные статьи
Description
DOI
Авторы:
Authors:
Ключевые слова:
Keywords:
Скачать pdf статьи:
Download the article:
Ссылка для цитирования:
For citation:
Таксономический статус и генетическая вариабильность Primula mazurenkoae (Primulaceae) выявленная методом ISSR-анализа и секвенированием региона ITS
References
- Буш Е.А. Сем. 65. Primulaceae // Флора Сибири и Дальнего Востока. Л., 1926. С.7–81.
- Ковтонюк Н.К. Семейство Primulaceae Batsch ex Borkh. // Конспект флоры Азиатской России. Сосудистые растения. Новосибирск. 2012. С. 130–137.
- Ковтонюк Н.К. Primula bukukunica – новый вид рода Primula (Primulaceae) // Ботанический журнал. 2009. Т. 94. № 12. С. 1835–1841.
- Ковтонюк Н.К. (ред.) Цифровой гербарий ЦСБС СО РАН: Электронный ресурс. Новосибирск: ЦСБС СО РАН. 2023. Режим доступа: http://herb.csbg.nsc.ru:8081 (дата обращения 06.03.2023).
- Пробатова Н.С. Первоцвет, или Примула – Primula L. // Сосудистые растения советского Дальнего Востока. Л., 1987. Т. 2. С. 139–151.
- Серегин А.П. (ред.) Цифровой гербарий МГУ: Электронный ресурс. М., 2023. Режим доступа: https://plant.depo.msu.ru/ (дата обращения 06.03.2023).
- Супрун Н.А., Шанцер И.А. Генетическая изменчивость видов родства Hedysarum grandiflorum Pall. (Fabaceae) по данным ISSR маркирования // Бюллетень Главного ботанического сада. 2012. Т. 198, вып. 4. С. 41–48.
- Федоров Ан.А. Первоцвет – Primula L. // Флора СССР. М.; Л., 1952. Т. 18. С. 111–202.
- Хохряков А.П. Флора Магаданской области. М., 1985. 397 с.
- Хохряков А.П. Десять новых видов и подвидов цветковых растений из Северо-Восточной Азии // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1984. Т. 89. Вып. 4. С. 107–108.
- Baasanmunkh S., Kovtonyuk N.K., Oyuntsetseg B., Tsegmed Z., Han I.V., Choi H.J. Diversity and distribution of the genus Primula L. (Primulaceae) in Mongolia // Journal of Asia-Pacific Biodiversity. 2020. Vol. 13. N 4. P. 687–700.
- Conti E., Suring E., Boyd D., Jorgensen J., Grant J., Kelso S. Phylogenetic relatioships and character evolution in Primula L.: the usefulness of ITS sequence data // Plant Biosystems. 2000. Vol. 134. N 3. P. 385–392.
- Crema S., Cristofolini G., Rossi M., Conte L. High genetic diversity detected in the endemic Primula apennina Widmer (Primulaceae) using ISSR fi ngerprinting // Plant Systematics and Evolution. 2009. Vol. 280. P. 29–36.
- GBIF: The Global Biodiversity Information Facility. 2023. Available from: https://www.gbif.org. Last accessed 17.04.2023.
- Guggisberg A., Mansion G., Kelso S., Conti E. Evolution of biogeographic patterns, ploidy levels, and breeding systems in a diploid–polyploid species complex of Primula // New Phytologist. 2006. Vol. 171. N 3. P. 617–632.
- Hu C.M., Kelso S. Primulaceae // Flora of China. Vol. 15. (Myrsinaceae through Loganiaceae). Beijing, St. Louis. 1996. P. 39–189.
- Hulten E. Flora of Alaska and Yukon // Acta Universitatis Lundensis. 1948. Vol. 44, N 1. P. 1268.
- Kovtonyuk N.K., Gontcharov A.A. Phylogenetic relationships in the genus Primula (Primulaceae) inferred from the ITS region sequences of nuclear rDNA // Russian Journal of Genetics. 2009. Vol. 45. N 6. P. 663–670.
- Martins L., Oberprieler C., Hellwig F. A phylogenetic analysis of Primulaceae s.l. based on internal transcribed spacer (ITS) DNA sequence data // Plant Systematics and Evolution. 2003. Vol. 237. P. 75–85.
- Mast A.R., Kelso S., Richards A.J., Lang D.J., Feller D.M.S., Conti E. Phylogenetic relationships in Primula L. and related genera (Primulaceae) based on noncoding chloroplast DNA // International Journal of Plant Sciences. 2001. Vol. 162. P. 1381–1400.
- Nan P., Shi S., Peng S., Tian Ch., Zhong Y. Genetic diversity in Primula obconica (Primulaceae) from Central and South-west China as revealed by ISSR Markers // Annals of Botany. 2003. Vol. 91. P. 329–333.
- Nei M., Li W.H. Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endonucleases // PNAS. 1979. Vol. 76. N 10. P. 5269–5273.
- Nuzhdina N.S., Kovtonyuk N.K. Genotyping NS and NSK herbaria specimens of Hedysarum (Fabaceae) using DNA sequencing // Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation. 2022. Т. 11. N 1. P. 176–180.
- POWO. Plants of the World Online. 2023. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. Published on the Internet; http://www.plantsoftheworldonline.org [Retrieved 06 March 2023].
- Richards J. Primula. Timber Press, Portland, Oregon, USA. 346 p.
- Schmidt–Lebuhn, A.N., Vos J.M., Keller B., Conti E. 2012. Phylogenetic analysis of Primula section Primula reveals rampant non–monophyly among morphologically distinct species // Molecular Phylogenetics and Evoution. 2012. Vol. 65. N 1. P. 23–34.
- Tamura K., Stecher G., Ku mar S. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11 // Molecular Biology and Evolution. 2001. Vol. 38. N 7. P. 3022–3027.
- Theodoridis S., Nogues Bravo D., Conti E. The role of cryptic diversity and its environmental correlates in global conservation status assessments: Insights from the threatened bird’s eye primrose (Primula farinosa L.) // Diversity and Distributions. 2019. Vol. 25. P. 1457–1471.
- Van de Peer Y., De Wachter R. TREECON for Windows: A software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment // Computer Applications in the Biosciences. 1994. Vol. 10. P. 569–570.
- Wolfe A.D. ISSR techniques for evolutionary biology // Methods of Enzymology. 2005. Vol. 395. P. 134–144.
- Yan H.-F., Hao G., Hu C.-M., Ge X.-J. DNA barcoding in closely related species: A case study of Primula L. sect. Proliferae Pax (Primulaceae) in China // Journal of Systematics and Evolution. 2011. Vol. 49, N 3. P. 225–236.
- Yudanova S.S., Plugatar S.A., Klimenko Z.K., Zykova V.K., Rubtsova O.L., Vasilyeva O.Yu. Genetic diversity analysis of Rose varieties from Grandifl ora group based on ISSR molecular markers // Northern Asia Plant Diversity. BIO Web of Conferences. 2021. Vol. 38. 00140. https://doi.org/10.1051/bioconf/20213800140
- Zhang L.B., Kadereit J.W. Classifi cation of Primula sect. Auricula (Primulaceae) based on two molecular data sets (ITS, AFLPs), morphology and geographical distribution // Botanical Journal of the Linnean Society. 2004. Vol. 146. P. 1–26.
Список литературы
- Буш Е.А. Сем. 65. Primulaceae // Флора Сибири и Дальнего Востока. Л., 1926. С.7–81.
- Ковтонюк Н.К. Семейство Primulaceae Batsch ex Borkh. // Конспект флоры Азиатской России. Сосудистые растения. Новосибирск. 2012. С. 130–137.
- Ковтонюк Н.К. Primula bukukunica – новый вид рода Primula (Primulaceae) // Ботанический журнал. 2009. Т. 94. № 12. С. 1835–1841.
- Ковтонюк Н.К. (ред.) Цифровой гербарий ЦСБС СО РАН: Электронный ресурс. Новосибирск: ЦСБС СО РАН. 2023. Режим доступа: http://herb.csbg.nsc.ru:8081 (дата обращения 06.03.2023).
- Пробатова Н.С. Первоцвет, или Примула – Primula L. // Сосудистые растения советского Дальнего Востока. Л., 1987. Т. 2. С. 139–151.
- Серегин А.П. (ред.) Цифровой гербарий МГУ: Электронный ресурс. М., 2023. Режим доступа: https://plant.depo.msu.ru/ (дата обращения 06.03.2023).
- Супрун Н.А., Шанцер И.А. Генетическая изменчивость видов родства Hedysarum grandiflorum Pall. (Fabaceae) по данным ISSR маркирования // Бюллетень Главного ботанического сада. 2012. Т. 198, вып. 4. С. 41–48.
- Федоров Ан.А. Первоцвет – Primula L. // Флора СССР. М.; Л., 1952. Т. 18. С. 111–202.
- Хохряков А.П. Флора Магаданской области. М., 1985. 397 с.
- Хохряков А.П. Десять новых видов и подвидов цветковых растений из Северо-Восточной Азии // Бюл. МОИП. Отд. биол. 1984. Т. 89. Вып. 4. С. 107–108.
- Baasanmunkh S., Kovtonyuk N.K., Oyuntsetseg B., Tsegmed Z., Han I.V., Choi H.J. Diversity and distribution of the genus Primula L. (Primulaceae) in Mongolia // Journal of Asia-Pacific Biodiversity. 2020. Vol. 13. N 4. P. 687–700.
- Conti E., Suring E., Boyd D., Jorgensen J., Grant J., Kelso S. Phylogenetic relatioships and character evolution in Primula L.: the usefulness of ITS sequence data // Plant Biosystems. 2000. Vol. 134. N 3. P. 385–392.
- Crema S., Cristofolini G., Rossi M., Conte L. High genetic diversity detected in the endemic Primula apennina Widmer (Primulaceae) using ISSR fi ngerprinting // Plant Systematics and Evolution. 2009. Vol. 280. P. 29–36.
- GBIF: The Global Biodiversity Information Facility. 2023. Available from: https://www.gbif.org. Last accessed 17.04.2023.
- Guggisberg A., Mansion G., Kelso S., Conti E. Evolution of biogeographic patterns, ploidy levels, and breeding systems in a diploid–polyploid species complex of Primula // New Phytologist. 2006. Vol. 171. N 3. P. 617–632.
- Hu C.M., Kelso S. Primulaceae // Flora of China. Vol. 15. (Myrsinaceae through Loganiaceae). Beijing, St. Louis. 1996. P. 39–189.
- Hulten E. Flora of Alaska and Yukon // Acta Universitatis Lundensis. 1948. Vol. 44, N 1. P. 1268.
- Kovtonyuk N.K., Gontcharov A.A. Phylogenetic relationships in the genus Primula (Primulaceae) inferred from the ITS region sequences of nuclear rDNA // Russian Journal of Genetics. 2009. Vol. 45. N 6. P. 663–670.
- Martins L., Oberprieler C., Hellwig F. A phylogenetic analysis of Primulaceae s.l. based on internal transcribed spacer (ITS) DNA sequence data // Plant Systematics and Evolution. 2003. Vol. 237. P. 75–85.
- Mast A.R., Kelso S., Richards A.J., Lang D.J., Feller D.M.S., Conti E. Phylogenetic relationships in Primula L. and related genera (Primulaceae) based on noncoding chloroplast DNA // International Journal of Plant Sciences. 2001. Vol. 162. P. 1381–1400.
- Nan P., Shi S., Peng S., Tian Ch., Zhong Y. Genetic diversity in Primula obconica (Primulaceae) from Central and South-west China as revealed by ISSR Markers // Annals of Botany. 2003. Vol. 91. P. 329–333.
- Nei M., Li W.H. Mathematical Model for Studying Genetic Variation in Terms of Restriction Endonucleases // PNAS. 1979. Vol. 76. N 10. P. 5269–5273.
- Nuzhdina N.S., Kovtonyuk N.K. Genotyping NS and NSK herbaria specimens of Hedysarum (Fabaceae) using DNA sequencing // Botanica Pacifica. A journal of plant science and conservation. 2022. Т. 11. N 1. P. 176–180.
- POWO. Plants of the World Online. 2023. Facilitated by the Royal Botanic Gardens, Kew. Published on the Internet; http://www.plantsoftheworldonline.org [Retrieved 06 March 2023].
- Richards J. Primula. Timber Press, Portland, Oregon, USA. 346 p.
- Schmidt–Lebuhn, A.N., Vos J.M., Keller B., Conti E. 2012. Phylogenetic analysis of Primula section Primula reveals rampant non–monophyly among morphologically distinct species // Molecular Phylogenetics and Evoution. 2012. Vol. 65. N 1. P. 23–34.
- Tamura K., Stecher G., Ku mar S. MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11 // Molecular Biology and Evolution. 2001. Vol. 38. N 7. P. 3022–3027.
- Theodoridis S., Nogues Bravo D., Conti E. The role of cryptic diversity and its environmental correlates in global conservation status assessments: Insights from the threatened bird’s eye primrose (Primula farinosa L.) // Diversity and Distributions. 2019. Vol. 25. P. 1457–1471.
- Van de Peer Y., De Wachter R. TREECON for Windows: A software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment // Computer Applications in the Biosciences. 1994. Vol. 10. P. 569–570.
- Wolfe A.D. ISSR techniques for evolutionary biology // Methods of Enzymology. 2005. Vol. 395. P. 134–144.
- Yan H.-F., Hao G., Hu C.-M., Ge X.-J. DNA barcoding in closely related species: A case study of Primula L. sect. Proliferae Pax (Primulaceae) in China // Journal of Systematics and Evolution. 2011. Vol. 49, N 3. P. 225–236.
- Yudanova S.S., Plugatar S.A., Klimenko Z.K., Zykova V.K., Rubtsova O.L., Vasilyeva O.Yu. Genetic diversity analysis of Rose varieties from Grandifl ora group based on ISSR molecular markers // Northern Asia Plant Diversity. BIO Web of Conferences. 2021. Vol. 38. 00140. https://doi.org/10.1051/bioconf/20213800140
- Zhang L.B., Kadereit J.W. Classifi cation of Primula sect. Auricula (Primulaceae) based on two molecular data sets (ITS, AFLPs), morphology and geographical distribution // Botanical Journal of the Linnean Society. 2004. Vol. 146. P. 1–26.